Как передать все образцы на вход до процесса merged_all
Антон, привет!!
Я решила сделать пробный csv файл с двумя образцами, чтобы посмотреть, как будет работать пайплайн, но столкнулась с тем, что он с первого процесса принимает только один файл, хотя раньше он принимал сначала все файлы, а потом по одному начинал анализировать. По этой причине, доходя до процесса объединения файлов, он выдает ошибку, что проанализирован был только один файл.
executor > local (1)
[b2/d0cac9] modkit_pileup (27000110) [ 0%] 0 of 1
[- ] reduce_by_id -
[- ] bgzip_tabix -
[- ] merge_all -
[- ] roi_stats -
[- ] bootstrap_ci -
[- ] find_candidates -Как мне задать анализ сначала всех файлов до процесса merged_all? Во вложении файл work.tsv с образцами, пайплайн и задаваемые параметры. Мне не хватает указания, что до процесса merged_all() надо проанализировать, объединить по ID сжать и проиндексировать все файлы.